Từ những 1990 s trở lên, sự tiếp cận chủ yếu để xây dựng phylogenies cho các cây sống đã được phân tử, mà sử dụng các nhân vật phân tử, đặc biệt là các chuỗi DNA, chứ không phải là các nhân vật thái độ như sự hiện diện hoặc vắng mặt của gai và quầng. Sự khác biệt là mã di truyền được sử dụng để quyết định các mối quan hệ tiến hóa, thay vì được sử dụng gián tiếp thông qua các nhân vật mà nó cung cấp cho bạn. Clive Stace mô tả điều này khi có quyền truy cập trực tiếp vào nền tảng tiến hóa di truyền. Như một ví dụ đơn giản, trước khi sử dụng bằng chứng di truyền, nấm đã được nghĩ là để làm cây hoặc để có liên quan chặt chẽ hơn với các loài động vật. Bằng chứng di truyền cho thấy rằng mối quan hệ tiến hóa thực sự của các sinh vật multicelled như được hiển thị trong Vạch dưới đây - nấm có liên quan chặt chẽ hơn với động vật hơn là để trồng cây.
Điều gì đã được sử dụng bây giờ cho các cây nhóm?
chuỗi DNA