Có sự phản đối khoa học nghiêm trọng đối với quá trình lựa chọn tự nhiên như là cơ chế chìa khóa của sự tiến hóa, bao gồm cả Karl von Nägeli đã khẳng định rằng một đặc trưng tầm thường không có lợi thế không thể được phát triển bằng cách lựa chọn. Darwin thừa nhận rằng những thứ này có thể được liên kết với các đặc điểm thích nghi. Ước tính của ông rằng tuổi của trái đất được cho phép tiến hóa từ từ đã được tranh cãi bởi William Thomson (sau đó trao danh hiệu Lord Kelvin), người đã tính rằng nó đã được làm mát trong chưa đầy 100 triệu năm. Darwin được chấp nhận hòa hợp cơ sở, nhưng Fleeming Jenkin tính toán rằng nó là đặc điểm hỗn hợp, lựa chọn tự nhiên không thể tích lũy các nét hữu ích. Darwin đã cố gắng gặp những phản đối này trong phiên bản thứ 5 Mivart được hỗ trợ hướng dẫn tiến hóa, và biên soạn khoa học và phản đối tôn giáo để lựa chọn tự nhiên. Trong phản hồi, Darwin đã thực hiện những thay đổi đáng kể cho phiên bản thứ sáu. Những vấn đề của độ tuổi của Trái đất và heredity chỉ được giải quyết vào thế kỷ 20.
Ai chấp nhận ước tính của Darwin rằng độ tuổi của trái đất được cho phép tiến hóa của loài người?
William Thomson