Năm 1565, các hoàng tử Rinbung mạnh mẽ đã bị lật đổ bởi một trong những bộ trưởng của chính họ, Karma tiến, người tự tạo ra mình là cái, người của Tsang, và thành lập cơ sở quyền lực của mình tại Shigatse. Người kế vị thứ hai của nhà vua Tsang đầu tiên này, Karma Phuntsok Namgyal, kiểm soát toàn bộ Trung tâm Tây Tạng (Ü-Tsang), đương kim từ 1611-1621. Bất chấp điều này, các nhà lãnh đạo của Lhasa vẫn khẳng định trung thành của họ với cái cũng như các Gelug, trong khi vị vua của Ü-Tsang liên minh với cái. Sự căng thẳng hoa hồng giữa thước Ü-Tsang và người Mông Cổ đã làm cho Dalai Lama của họ ở Lhasa. Đức Dalai Lama thứ tư từ chối đưa ra một khán giả cho nhà vua ü-Tsang, đã gây ra một xung đột như sau đó bắt đầu tấn công các nhà thờ Gelug. Chen viết về những suy đoán vượt qua cái chết bí ẩn của Dalai Lama và cốt truyện của vị vua ü-Tsang để khiến anh ta bị giết vì nguyền rủa anh ta với bệnh tật, mặc dù Chen viết rằng vụ giết người có nhiều khả năng là kết quả của một cuộc đấu tranh quyền lực phong kiến. Năm 1618, chỉ có hai năm sau khi Yonten gyatso chết, cái và Karma Kargyu đã đi đến chiến tranh, Karma Kargyu được hỗ trợ bởi nhà vua Ü-Tsang. Nhà lãnh đạo Ü-Tsang đã có một số lượng lớn Gelugpa lamas bị giết, đã chiếm nhà thờ của họ tại Drepung và Sera, và cấm bất kỳ nỗ lực nào để tìm một Dalai Lama khác. Năm 1621, nhà vua Ü-Tsang đã qua đời và được thành công bởi con trai trẻ Karma Tenkyong, một sự kiện gây ra sự nỗ lực chiến tranh khi người cuối cùng chấp nhận gyatso gyatso 1621 tuổi như Dalai Lama mới. Bất chấp những nỗ lực ngoại giao của Dalai Lama để duy trì mối quan hệ thân thiện với các nhà lãnh đạo mới của Ü-Tsang, Sonam Rapten (1595-1657), người quản lý trưởng của Dalai Lama và thủ quỹ tại Drepung, nỗ lực để lật đổ vị vua của Ü-Tsang, dẫn đầu cho một xung đột khác. Năm 1633, cái và vài ngàn người Mông Cổ đã đánh bại quân đội của Ü-Tsang gần Lhasa trước khi một cuộc đàm phán hòa bình đã được giải quyết. Goldstein viết rằng trong này người Mông Cổ lại đóng vai một vai trò quan trọng trong các vấn đề Tây Tạng, lần này là cánh tay quân sự của Đạt Lai Lạt Ma.
Khi nào Karma Phuntsok Namgyal triều đại?
1611-1621