Năm 1821, Mexico giành chiến thắng độc lập từ Tây Ban Nha, và San Diego trở thành một phần của lãnh thổ Mexico của Alta California. Năm 1822, Mê-hi-cô bắt đầu cố gắng mở rộng quyền lực của mình trên lãnh thổ ven biển Alta California. Pháo đài trên Presidio Hill đã dần bị bỏ rơi, trong khi thị trấn San Diego lớn lên trên vùng đất dưới Presidio Hill. Nhiệm vụ đã được chính phủ Mê-hi-cô bắt đầu vào năm 1833, và hầu hết các vùng đất sứ mệnh đã được bán cho những người di cư giàu có. 432 cư dân của thị trấn yêu cầu thống đốc thành lập một pueblo, và Juan María Osuna đã được bầu cho alcalde đầu tiên (phán quan thành phố), đánh bại Pío Pico trong cuộc bầu cử. (Xem, Danh sách thị trường trước bang của San Diego.) Tuy nhiên, San Diego đã mất dân số trong suốt những năm 1830 và trong năm 1838 thị trấn mất đi trạng thái pueblo bởi vì kích thước của nó giảm đến một dự kiến 100 150 cư dân. Bên kia vùng đất Mexico cho phép mở rộng số lượng của California ranchos mà khiêm tốn thêm vào nền kinh tế địa phương.
Ai được bầu làm phán quan thành phố đầu tiên của nhiệm vụ?
Juan María Osuna