Nhiễm trùng bắt đầu khi một sinh vật thành công trong cơ thể, lớn lên và thêm nhiều. Điều này được gọi là colonization. Hầu hết con người không dễ bị nhiễm trùng. Những người yếu đuối, bệnh tật, bệnh tật, bị ung thư hoặc bị tiểu đường đã tăng cường độ nhiễm trùng cho bệnh viêm nhiễm kinh niên hoặc dai dẳng. Các cá nhân có một hệ thống miễn dịch bị ngăn chặn đặc biệt là dễ bị nhiễm trùng với các nhiễm trùng. Lối vào chủ nhà tại giao diện chủ nhà, thường xảy ra thông qua các niêm mạc ở orifices như các khoang miệng, mũi, mắt, sinh dục, hậu môn, hoặc cái có thể tham gia qua các vết thương mở. Trong khi một vài sinh vật có thể phát triển tại trang ban đầu của mục nhập, nhiều người di cư và gây nhiễm trùng cơ thể ở các cơ quan khác nhau. Một số bệnh nhân phát triển trong các tế bào chủ nhà (intracellular) trong khi những người khác phát triển tự do trong các chất lỏng cơ thể.
Khi nào thì nhiễm trùng bắt đầu?
 khi một sinh vật thành công vào cơ thể, lớn lên và thêm nhiều.