Bộ phim được thiết lập ba năm sau khi các sự kiện của Digimon Phiêu lưu 02, khi Digimon trở thành kẻ phản bội bởi một nhiễm trùng bí ẩn xuất hiện để gây ra sự tàn phá trong thế giới loài người. Tài và những người khác từ chuỗi gốc đoàn tụ với các đối tác của họ và bắt đầu chiến đấu trở lại với sự hỗ trợ từ chính phủ Nhật Bản, trong khi Davis, Yolei, Cody và Ken bị đánh bại bởi một kẻ thù mạnh mẽ gọi là Alphamon và biến mất không có một dấu vết. Tài và những người khác cũng gặp một DigiDestined khác được gọi là Meiko Mochizuki và đối tác của cô ấy Meicoomon người trở thành bạn bè của họ, cho đến khi Meicoomon trở thành kẻ thù và chạy trốn sau một cuộc gặp gỡ với Ken, người tự nhiên đột ngột, một lần nữa là Digimon Hoàng đế. Bộ phim cũng tính năng nhiều người có đối tác của họ Digivolve lên Mega cấp lần đầu tiên, một kết quả chỉ có Tai và Matt đã đạt được trước đó.
Làm thế nào sớm sau khi làm một loạt phim khác bắt đầu sau cuộc Phiêu lưu Digimon 02?
ba năm